Το έργο ανασυγκρότησης χρηματοδοτήθηκε από τον Ισπανό Cruz y Ortiz, η έκθεση σχεδιάστηκε από τον Jean-Michel Wilmotte και η αποκατάσταση πραγματοποιήθηκε από τον Van Hoogevest Architecten. Το έργο των αρχιτεκτόνων ήταν να προσαρμόσουν το ογκώδες κτίριο στο ρεύμα του εκλεκτισμού, που χτίστηκε το 1885 από τον Petrus (Pierre) Kuypers, για τις ανάγκες ενός μουσείου του 21ου αιώνα. Οι πλούσιοι εσωτερικοί χώρισαν την προσοχή από τα εκθέματα, δεν υπήρχε αρκετός χώρος τόσο για τις εκθέσεις όσο και για το συνοδευτικό πρόγραμμα, ήταν αδύνατο να οργανωθεί η μόνιμη έκθεση σύμφωνα με ένα μόνο σύστημα, και ούτω καθεξής.
Τώρα όλα τα εκθέματα από τον 12ο έως τον 20ο αιώνα διοργανώνονται με αυστηρή χρονολογική σειρά, από δάπεδα από κάτω προς τα πάνω και η χρονολογία υποστηρίζεται από ένα χρωματικό σχέδιο: το χρώμα στους τοίχους φωτίζει σταδιακά καθώς κινείται προς τα πάνω, φτάνοντας σχεδόν λευκό στις αίθουσες της σύγχρονης τέχνης. Ταυτόχρονα, όλα τα έργα οργανώθηκαν με νέο τρόπο, με εξαίρεση το πιο σημαντικό - "Night Watch" από τον Rembrandt, ο οποίος επέστρεψε στην προηγούμενη θέση του στην "Πινακοθήκη Τιμής", όπου τα έργα του Golden Εκτίθενται η εποχή της ολλανδικής τέχνης.
Οι αρχιτέκτονες, σύμφωνα με το ήδη καθιερωμένο σχέδιο κατασκευής μουσείων, μπλόκαραν δύο αυλές του κτηρίου με γυάλινες στέγες, και επίσης τους έβαλαν στο επίπεδο του -1 ορόφου, αφού είχαν αφαιρέσει προηγουμένως τις μεταγενέστερες επεκτάσεις που τους κατείχαν. Στη συνέχεια, τοποθέτησαν ένα αμφιθέατρο κάτω από τη μια αυλή και ένα μουσείο και ένα καφέ κάτω από το άλλο. Οι ίδιες οι αυλές έχουν μετατραπεί σε ευρύχωρους δημόσιους χώρους στους οποίους μπορείτε να έχετε πρόσβαση ακόμα και χωρίς να αγοράσετε εισιτήριο. Οι τοίχοι τους σχηματίζουν τις αυλές του μουσείου και οι νέες επιφάνειες έχουν ανοιχτόχρωμη πέτρα. Ο Antonio Cruz και ο Antonio Ortiz έλαβαν υπόψη το λάθος του Norman Foster, στην αυλή του Βρετανικού Μουσείου ο οποιοσδήποτε ήχος είναι καθαρά ακουστός και ακόμη και αντηχεί, έτσι στο Rijksmuseum, οι θόρυβοι είναι γεμάτοι από λευκές σχάρες με υλικό που απορροφά τον ήχο αιωρούμενο από τις οροφές.
Αλλά το κύριο πρόβλημα για τους αρχιτέκτονες ήταν η ένωση των δύο αυλών σε ένα ενιαίο σύνολο. Το ιστορικό κτήριο διαθέτει διάδρομο πεζών και ποδηλατών στο κέντρο της πρόσοψης, επιτρέποντας γρήγορη διέλευση από το κτήριο. Το έργο ανοικοδόμησης προέβλεπε τη μετατροπή του στην κύρια είσοδο του μουσείου, ενώνοντας και τις δύο αυλές, αλλά οι κάτοικοι της πόλης επαναστάτησαν, και τώρα ο διάδρομος διατηρείται στην αρχική του μορφή, το μουσείο μπορεί να προσεγγιστεί μέσω τεσσάρων μικρών εισόδων και ένα υπόγειο πέρασμα τοποθετήθηκε κάτω από αυτό, συνδέοντας τις αυλές μεταξύ τους.
Το μουσείο έκλεισε για ανασυγκρότηση το 2003 και επρόκειτο να ανοίξει ήδη το 2008. Η δεκαετής περίοδος εργασίας εξηγείται από το γεγονός ότι έπρεπε να καταβληθούν τιτανικές προσπάθειες για την κατασκευή υπόγειων επιπέδων στο γεμάτο νερό έδαφος του Άμστερνταμ και δεν υπήρχε ανάδοχος για ένα τόσο περίπλοκο έργο. Οι μηχανικοί της Arcadis έκαναν τα νέα υπόγεια τμήματα του κτηρίου ανεξάρτητα από την ιστορική κατασκευή, καθώς υποχωρεί αργά. Επομένως, ο επίγειος διάδρομος και η «Πινακοθήκη Τιμής» που βρίσκεται πάνω από το υπόγειο πέρασμα μεταξύ των αυλών έχουν πλέον μετατραπεί σε «γέφυρα» που κρέμεται πάνω του. Τα σκαμμένα λάκκα γεμίστηκαν αμέσως με νερό, οπότε χύθηκαν με ειδικό σκυρόδεμα για υποβρύχια εργασία και η διαδικασία ελέγχθηκε από δύτες.
Ο προϋπολογισμός του έργου ήταν 375 εκατομμύρια ευρώ, αλλά περιλαμβάνει επίσης την κατασκευή ενός ξεχωριστού περιπτέρου ασιατικής τέχνης, τοποθετημένο στο κέντρο της λίμνης, την προσαρμογή του πάρκου σε έναν κήπο γλυπτικής από το έργο Copijn Landschapsarchitecten (14.500 m2), η κατασκευή ενός κτιρίου εισόδου υπηρεσίας, η ανοικοδόμηση της ιστορικής Σχολής Σχεδίου (Teekenschool) ως εκπαιδευτικού κέντρου μουσείων, καθώς και η κατασκευή ενός κτιρίου εργαστηρίων μουσείων κοντά στο Rijksmuseum, συγχωνεύθηκε με ένα άλλο κτίριο Kuypers - το πρώην Ινστιτούτο Εργασιακή ασφάλεια και υγεία.
Ωστόσο, η ανακαίνιση του μουσείου δεν έχει ολοκληρωθεί ακόμη: παρέμεινε ανοιχτό καθ 'όλη τη διάρκεια της ανοικοδόμησης
η πτέρυγα Philips θα μετατραπεί πλέον σε έναν σύγχρονο προσωρινό εκθεσιακό χώρο. Οι συγγραφείς του έργου είναι επίσης Cruz y Ortiz.
